Jagdkommandokräfte halten sich ständig für Einsätze im In- und Ausland bereit. Im Regelfall erledigen sie ihre Aufträge mit kleinen, unerkannt eingesetzten Einheiten. Dabei nehmen die Soldaten folgende Aufgaben wahr:
Spezialaufklärung zur Gewinnung von wichtigen Informationen,
Kommandounternehmen - etwa zur Befreiung von als Geiseln festgehaltenen Militärpersonen, Festnahme von gesuchten Personen wie Kriegsverbrechern oder Vernichtung von gefährlichen Waffen-Stellungen,
gegebenenfalls Personenschutz.

Ein Teil der Kräfte steht ständig für Einsätze bereit.

Bei der Evakuierung von österreichischen Staatsbürgern aus Krisengebieten sorgen Soldaten des Jagdkommandos für deren Sicherheit.

In internationalen Einsätzen unterstützt das Jagdkommando reguläre Einheiten des Bundesheeres, wenn es die besondere Gefährdungssituation eines Krisengebietes verlangt.